Pusat Deseminasi Intelektual dan Perpustakaan UIM dipimpin oleh seorang Kepala Pusat, yang bertanggung jawab langsung kepada Rektor Universitas Indonesia Mandiri melalui Wakil Rektor Bidang Akademik.
Struktur Organisasi terdiri atas:
- Kepala Pusat
- Kepala Bagian Layanan dan Sirkulasi
- Kepala Bagian Koleksi dan Katalogisasi
- Kepala Bagian Teknologi dan Informasi Digital
- Kepala Bagian Kerja Sama dan Pengembangan Literasi
- Staf Administrasi dan Pelayanan Teknis